Das Museum für Natur und Umwelt bietet spannende Einblicke in die Naturgeschichte Schleswig-Holsteins sowie in die artenreiche Tier- und Pflanzenwelt des Lübecker Raumes. Außerdem werden Sonderausstellungen zu verschiedenen aktuellen Themen gezeigt.

Prominente Ausstellungsstücke und europaweit einzigartig sind die in der Nähe von Groß Pampau gefundenen fossilen Walskelette. Vor etwa 11 Millionen Jahren tummelten sich verschiedene Walarten hier im Miozänmeer. Im Glasanbau im Domhof ist das riesige 14 Meter lange Skelett eines Pottwals aus der Gegenwart zu sehen, der im Dezember 1997 vor der dänischen Insel Römö strandete. „Im Reich des Wassermanns” heißt die große Naturerlebnisausstellung, die die heimischen Flüsse Trave und Wakenitz und die nahe Ostsee auf neue und spannende Weise präsentiert und der Wassermann lockt sein Element zu entdecken.

Die Natur zu verstehen war bereits das Anliegen des Lübecker Arztes Johann Julius Walbaum, dessen Nachlass 1799 den Grundstock für das Lübecker Naturkundemuseum bildete. Damit blickt das Haus auf die längste Museumsgeschichte der Lübecker Museen zurück. Es bietet eine Fülle von museumspädagogischen Angeboten, Vorträgen, Seminaren, Ferienprogrammen, Exkursionen und Veranstaltungen an.