Neben der Geschichte der Stadt dokumentiert das Museum auch die Entwicklung der Nachbargemeinden. Die Region an der Aare bildet einen Raum mit vielen geschichtlichen Gemeinsamkeiten. So besassen die Gründer der Stadt, die Grafen von Frohburg, eine mächtige Stammburg auf einer Juraanhöhe im Gemeindegebiet von Trimbach und viel Einfluss in der Stadt Zofingen. Olten besass eine starke Stellung als Marktort. Zu den Hauptthemen des Historischen Museums Olten gehört die Verkehrsgeschichte in diesem Raum, weil sich hier seit ältester Zeit grosse Handelsrouten treffen und kreuzen. Eine Spezialsammlung des Museums ist dem Gebiet der Lichtkultur gewidmet.